いつもお世話になっております。
米原です。
>batchUpdate()の実行時のSQLのログで、
>Where句に排他制御用の条件が付与されていますか？
>（ex. WHERE BOOK_ID = 2 AND U_TIMESTAMP = '2007...'）
はい、付与されています。
>また、batchUpdate()の戻り値は何が入っていますでしょうか？
>int[]の中身をご確認お願いします。
１回目のbatchUpdate,２回目のbatchUpdate（楽観排他時）とも
「-2」が入っていました。
ログを見るとそれぞれ、同じ以下の結果です。
（All updated count: -2 result={-2}）